Університет активно працює над залученням до міжнародної освітньої  та наукової спільноти. ПЗВО «МЄУ» долучився до Research For Life, яка об’єднує п’ять міжнародних програм: Hinari (дослідження у сфері здоров’я), AGORA (дослідження сільського господарства), OARE (дослідження навколишнього середовища), ARDI (розвиток та інновації) та GOALI (дослідження у сфері юриспруденції). Також Університет підписав Меморандуму про створення та розвиток мережі з визнання іноземних освітніх кваліфікацій.

Університет співпрацює з такими організаціями як: