Однією із форм міжнародної інтеграції Полтавського державного медичного університету є членство у провідних академічних організаціях, що є важливим показником інтернаціоналізації та міжнародного визнання. Університет є повноправним членом Міжнародної асоціації університетів (International Association of Universities (IAU), Франція), Європейської асоціації університетів (European University Association (EUA), Бельгія), Міжнародної федерації асоціацій студентів-медиків (Данія) та підписантом Великої Хартії Університетів (Magna Charta Universitatum). ПДМУ сертифікований Державною комісією США, яка займається іноземними випускниками вищих медичних закладів (ECFMG)/FAIMER та визнаний Медичною радою Індії, Міністерством Освіти Хашемітського Королівства Йорданії. За результатами міжнародного рейтингу Webometrics, Консолідованого рейтингу ЗВО України, рейтингу університетів України «ТОП-200 Україна» та наукометричної бази даних SciVerse Scopus Полтавський державний медичний університет займає провідні позиції серед вищих медичних навчальних закладів України.